大标本成像系统商家带来光片显微镜技术小课堂——数据的处理

大标本成像系统商家带来光片显微镜技术小课堂——数据的处理

光片显微镜的一个显著优点是能够在数小时（或数天）内以非常高的时间与空间分辨率对大样本进行成像，但由此导致的结果是会产生巨大的数据量，很容易达到TB级别，于是样本成像的速度不再受图像采集速度的限制，而是受数据处理电脑、存储容量和数据传输速度的限制。

当以中等帧速成像时，相机采集的数据可以简单地通过消费级市场标准的连接传输到采集电脑的存储磁盘，甚至使用网络连接传输到云端的普通存储电脑。如果使用速度更快的相机，数据传输速度将会成为限制。有些相机允许图像数据流保存到内部存储器，需要在采集后读出；其他相机则选择采用更快的数据连接，这在大多数情况下需要在计算机中安装额外的硬件（图像采集卡）。然后，数据流要么传输到足够大的主存储器，要么以同样快的速度（避免数据丢失）传输到专用的数据存储设备。

还有一种办法则是通过图像压缩来降低数据量。图像数据可以在相机、图像采集卡、处理器（CPU）或图形处理卡（GPU）中压缩。这样的确能直接减轻数据传输和存储系统的压力，但增加了对压缩和随后解压缩的处理能力的需求。

解决数据量问题的一个更有效的选择是在拍摄前预定义感兴趣的区域（ROI），并仅存储这些区域的数据。这种实时处理的方法一般是为特定的某个标本或科学问题定制的，但可以使图像数据本身减少很多。同时，在处理过程中数据已经很好地被可视化，以便于进一步的数据分析。